Πλήρως εναρμονισμένη με την πρώτη ομάδα και σε απόλυτα επαγγελματικό πλαίσιο λειτουργεί η Ακαδημία του Παναθηναϊκού.
Λίγο πριν το κλείσιμο των αγωνιστικών υποχρεώσεων της σεζόν 2016-17, οι ομάδες της Ακαδημίας του Παναθηναϊκού υποβλήθηκαν σε εργομετρικές εξετάσεις υπό την επίβλεψη του εργοφυσιολόγου και διατροφολόγου του “Τριφυλλιού”, Γιάννη Κωτσή.
Οι εξετάσεις θα επαναληφθούν με την έναρξη της επόμενης αγωνιστικής περιόδου και τα αποτελέσματα των δύο εξετάσεων θα αποτελέσουν οδηγό για το τεχνικό τιμ των ομάδων.